南昌市第一医院胃肠外科传承于上世纪五十年代，秉承优良传统，继承和发扬了精湛的医疗技术，学术风气浓厚。科室着眼国内先进、走专科化发展的方向，在胃肠、肛门外科、疝及腹壁外科等多个专业领域均取得了好成绩，在省内学术界享有盛誉。
胃肠外科是医院的重点优势学科与重点发展专科，技术力量雄厚，科室拥有主任医师1名，副主任医师6名，主治医师1名，住院医师3名，硕士研究生3名，是集医疗、教学、科研为一体的专业学科，我科承担省内多所高校本科教学任务，并主持完成多项省科技厅、卫生厅，市科技局研究课题，发表论文几十篇。
科室团队一直坚持腹腔镜微创治疗理念为指导的发展模式，同时致力于胃癌、结直肠癌等肿瘤规范化治疗体系以及MDT体系的建立，科室目前已经达到90%胃肠手术腹腔镜微创治疗，腹腔镜下开展的胃癌D2标准的根治术、直肠癌TME技术下的根治术、低位/超低位直肠癌保肛治疗、基于膜解剖的结肠癌根治术取得了非常满意的疗效，为大量病人解除了病痛。在代谢外科理念指导下，引进GBP手术，在治疗Ⅱ型糖尿病、肥胖减重方面取得疗效。使我院胃肠外科的治疗水平站在了南昌地区的领先行列。
在肛肠治疗领域，在省内率先引进痔上黏膜环切钉合术（PPH）技术，为Ⅲ、Ⅳ度混合痔的治疗带来了新的理念，并主持完成了该项目在省卫生厅的课题研究且全省推广，至今治疗病例已数千例。
科室一直在疝专科研究领域跟随国内国际先进水平同步发展，早期就开展了腹腔镜下采用TAPP、TEP、IPOM等技术微创治疗各种腹壁疝，并且以Lichtenstain技术、腹膜前间隙修补技术（UHS）针对高龄患者开展局麻下的疝修补术，成为了我科重要特色。我科是江西省肠外瘘及营养学的领先学科，在治疗各种复杂原因导致的肠外瘘及场内、肠外营养支持治疗上有着深入的探索和丰富的经验。