南昌市第一医院脑外科建立于1988年，是江西省最早成立的脑科疾病治疗专科，目前是南昌市第二批重点培育学科。拥有床位30张，独立神经重症监护室一个，配有14张重症监护病床，有6台呼吸机，10余台心电监护仪，1台莱卡显微镜、1台史托斯神经内镜，技术力量雄厚，专业技术人员配备完整，其中主任医师1人，副主任医师3人，硕士生导师1人，博士生1人、硕士6人。在研省市级课题2项，申报院级新技术2项。发表各级论文10余篇。我科是江西省率先开展神经介入诊疗科室，能完成颅内动脉瘤栓塞术及几乎所有神经介入类手术，颅内动脉瘤诊疗水平达到省内领先水平，并且在省内率先开展鼻咽癌口鼻大出血介入栓塞治疗，达到国内领先水平。在颅脑外伤诊疗上，我科开展了颅脑损伤各类手术，形成了重症监护特色，应用有创颅内压监测技术，用循证医学方法科学规范治疗，提高重型颅脑损伤的生存率、大大降低其死亡率。在神经肿瘤诊疗上，我科开展了各类颅脑肿瘤和椎管肿瘤手术，拥有高速磨钻等现代化手术设备，形成以神经内镜治疗垂体肿瘤的亚专科特色。我科在省内较早开展面肌痉挛、三叉神经痛显微血管减压术，有效率达到95%以上，并开展脑深部电刺激术及脊髓电刺激术等新技术。近年来，脑外科承担南昌大学本科及研究生教学任务，及南昌市第一医院神经外科住院医师规范化培训及专业培训基地。
脑外科是我院重点建设和发展的学科，注重学科建设，借助校市合作为依托，依靠相关慢病科室，联合一附院神经外科专家打造亮点品牌，提升科室影响力，加大人才培养力度，增强科研实力，注重临床见习与带教，定期举办专业知识业务讲座，加强交流与宣传。以发展新技术为动力，以新院区开张为契机提高服务病患的能力。